Enligt den danska tidningen Ekstra Bladet är totalt 14 av 18 avgångar med det tyska flygbolaget inställda, och även 14 av 18 ankomster.
Kastrups presstjänst säger till TT att det beror på pilotstrejken hos Lufthansa.
Från Arlanda är två av sex avgångar med Lufthansa inställda på torsdagen. Under fredagen är sex av nio avgångar inställda.
Tidigare i veckan varslade fackförbundet Vereinigung Cockpit om en tvådagarsstrejk. Detta då inblandade parter inte har kommit överens i samtalen om pensionsnivåer.
