Matteo Politano och Giacomo Raspadori nätade för hemmalaget, medan Olivier Giroud blev tvåmålsskytt för gästerna.
Det här var Napolis tredje oavgjorda match den här säsongen.
Napoli ligger på fjärde plats i tabellen efter matchen, medan AC Milan är på tredje plats.
Lördag 4 november möter Napoli Salernitana borta 15.00 och Milan möter Udinese hemma 20.45.