Avrådan gäller alla resor inom ett avstånd av 20 kilometer från gränsen till Kambodja, samt icke nödvändiga resor till övriga delar av provinserna Buriram, Surin, Sisaket och Ubon Ratchathiani, skriver man i ett pressmeddelande.
Sedan tidigare avråder UD från icke nödvändiga resor till provinserna Narathiwat, Yala, Pattani och Songkhla.
Avrådan gäller tills vidare.
Ett hundratal svenskar kan befinna sig i gränsområdet men ingen har sökt konsulärt stöd, uppgav UD på torsdagen.
Thailand har utropat militärt undantagstillstånd i åtta gränsdistrikt.
Sammandrabbningarna bröt ut natten mot torsdagen, sedan fem thailändska soldater skadats i en minexplosion.
Strider har skett på minst sex platser i ett omstritt gränsområde, enligt Thailands försvarsdepartement. Båda sidor har skjutit mot varandra, samt avfyrat artilleri och raketer. Thailand har även genomfört flygräder.
Sporadiska våldshandlingar har skett mellan länderna de senaste 15 åren. Relationen har försämrats betydligt sedan maj, då en kambodjansk soldat sköts ihjäl vid gränsen.
FN:s säkerhetsråd kommer att hålla ett krismöte om gränskonflikten på fredagen.