Majid Mosayebi dömdes för att ha försökt lämna ”känslig information” till Israels underrättelsetjänst Mossad.
Mannen ”hängdes i morse efter att ha genomgått hela den straffrättsliga processen och efter att hans dom hade bekräftats av Högsta domstolen", skriver Mizan.
Iran har gripit flera personer som misstänks ha spionerat för Israel sedan landet anföll Iran natten mot fredagen den 13 juni.
Enligt en talesperson för rättsväsendet skedde tre gripanden genom "befolkningens snabba närvaro och dess hjälp till underrättelsetjänster, brottsbekämpande myndigheter och rättsväsende".
En av dem är enligt talespersonen europeisk medborgare.
Senast i måndags rapporterades en annan man – ockå anklagad för spioneri för Mossads räkning – ha avrättats genom hängning.