Mannen, Mohammad-Amin Mahdavi Shayesteh, hängdes tidigt på måndagen, meddelar Irans rättsväsende.
Avrättningen sker bara ett dygn efter det att en annan man, Majid Mosayebi, hängdes. Han hade dömts för att ha försökt lämna ”känslig information” till Israels underrättelsetjänst Mossad.
Avrättningarna sker samtidigt som kriget mellan de båda länderna går in på sitt elfte dygn. Mossad anses ha spelat en viktig roll i det israeliska anfallet, operationen ska ha förberetts i åratal och bland annat innefattat att drönare med sprängämnen smugglats in i Iran.
Iran har gripit flera personer som misstänks ha spionerat för Israel sedan landet anföll Iran natten mot fredagen den 13 juni.
