Vrakdelar från drönaren hittades av en jordbruksarbetare i Estlands sydöstra delar under tisdagen. Ingen människa ska ha kommit till skada.
”Utifrån vår utredning har vi anledning att tro att det rör sig om en ukrainsk drönare som riktats mot mål i Ryssland”, säger Margo Palloson, generaldirektör för Estlands säkerhetstjänst.
Drönaren tros ha störts ur sin projektilbana av rysk elektronisk påverkan och därför hamnat inom estniskt luftrum – ett tillvägagångssätt som Ryssland ofta begagnar sig av, enligt Palloson.
Grannländer till Ryssland och Ukraina har länge rapporterat om inkräktande drönare från bägge länderna.
I förra veckan fördömde den polske försvarsministern Wladyslaw Kosiniak-Kamysz en rysk ”provokation” sedan en rysk drönare exploderat på ett fält i östra Polen, utan att orsaka personskador.