Även ett samhälle nära militärbasen angreps i räden, som tros vara utförd av terrorrörelsen Boko Haram eller anslutna undergrupper.
Nigerias militär har bekämpat rörelsen i 16 år. Insatserna försvåras av att flera rebellgrupper härjar i regionen vid gränsen till Kamerun.
Klicka här för att följa oss på GoogleAngreppen skedde på tisdagen, där en eldstrid utbröt när Boko Haram anföll basen.
Därefter attackerades samhället Ngoshe, där ett 30-tal personer – mest kvinnor och barn – fördes bort, enligt separata källor.
Nigerias militär, som inte kommenterat uppgifterna, ska därefter ha attackerat militanta fästen och dödat omkring 50 misstänkta terrormedlemmar.
