Supportrarna hölls kvar inne på arenan av belgisk polis med hänvisning till säkerhetsskäl.
"Vid 04.00 lämnade de sista svenska supportrarna, tillsammans med SvFF:s kvarvarande personal, arenan med polisbevakning", säger Svenska fotbollförbundet (SvFF) i ett uttalande.
Svenska supportrar undr polisbevakning
SvFF tillägger att samtliga hotell där svenska supportrar bor är under polisbevakning.
"Samarbetet mellan supportrar, förbund och myndigheter har fungerat mycket väl i en extremt pressad situation. Totalt har cirka 400 svenskar fått hjälp under kvällen och natten", säger SvFF:s säkerhetschef Martin Fredman.
Landslaget har flugit hem till Sverige
Landslaget har flugit hem till Sverige och spelare och ledare har återvänt till sina klubblag.
EM-kvalmatchen bröts i halvtid, vid ställningen 1–1.
Den misstänkte gärningsmannen Abdesalem Lassoued är fortsatt på fri fot.