Det var redan i den 15 minuten som 26-åringen slog till från drygt 20 meter. Avslutet med högern gick lågt, precis innanför muren, och Bragamålvakten Lukás Hornícek hann aldrig ner till sin högra stolprot.
Målet var Viktor Gyökeres 31:a ligamål på 27 matcher, vilket är två fler än vad svensken mäktade med under förra säsongen.
Det såg länge ut att bli matchens enda mål, men i den 87:e minuten kvitterade Afonso Patrao för gästerna och 1–1 blev slutresultatet.
Poängtappet innebär att Benfica nu toppar den portugisiska ligan på 68 poäng – två poäng före det regerande mästarlaget Sporting Lissabon. Sex matcher återstår av ligasäsongen.