Ingen spelare kom till skada, uppger nyhetsbyrån AP.
Klubben bekräftar i ett uttalande att några bilar utsattes för en attack på väg hem från 1–1-mötet i Copa Libertadores – Sydamerikas motsvarighet till Champions League – med Central Cordoba i den argentinska staden Santiago del Estero.
Fyra kulor träffade den bil som Flamengos argentinske målvakt Agustin Rossi färdades i. Rossi är en av lagets främsta spelare och tillhörde tidigare Boca Juniors i Buenos Aires.
Polisstyrkor i Rio de Janeiro kallades in för att söka efter skyttarna.
Flamengos spelare fördes av säkerhetsskäl till en polisstation. Det är oklart vilka som låg bakom attacken och varför den utfördes.
Flamengo är en av favoriterna att vinna Copa Libertadores men är bara trea i sin grupp med fem poäng. Liga de Quito och Central Cordoba står båda på åtta.
