Det nya avtalet, där Eklund sexdubblar sin lön, inleds när hans rookieavtal går ut inför säsongen 2026–2027.
22-åringen skriver ett treårskontrakt värt cirka 160 miljoner kronor.
Förra säsongen gjorde Eklund 58 poäng på 77 matcher i San Jose. Han anslöt till klubben från Djurgården 2022.
William Eklunds lillebror Victor Eklund blev i förra veckan draftad av New York Islanders i första rundan av NHL-draften.