Isak har missat fyra matcher för Liverpool de senaste veckorna på grund av en ljumskskada. När han nu var tillbaka i lagets spelartrupp blev det noll spelminuter och en storförlust för de regerande mästarna.
Erling Haaland hade chansen att inleda målskyttet på straff i den 13:e minuten, men Liverpoolmålvakten Giorgi Mamardashvili kunde rädda anfallarens svaga försök.
Missa inget viktigt, följ oss på GoogleI stället spräckte norrmannen målnollan en kvart senare när han nickade in Matheus Nunes inlägg och gjorde sitt 13:e Premier League-mål för säsongen.
På första halvlekens tilläggstid gjorde Nico González 2–0 för hemmalaget, innan Jeremy Doku avslutade målskyttet i andra halvleken med ett läckert skott utifrån.
Liverpool hade sina lägen, men avsluten gick antingen utanför mål eller i händerna på Citys målvakt Gianluigi Donnarumma. Bortalaget hade en boll i nät vid 0–1-underläge när Virgil van Dijk nickade in en hörna, men det dömdes bort för offside.
Citytränaren Pep Guardiola gjorde på söndagen sin 1 000:e match som fotbollstränare, och nådde alltså milstolpen på bästa sätt.
Manchester City ligger nu tvåa i Premier League, Liverpool åtta.
