Malmö FF startade matchen bäst och tog ledningen. Oliver Berg gjorde målet, redan i 19:e minuten.
Laget gjorde också 0-2 strax före halvtidsvilan, genom Stefano Vecchia. Det dröjde till den 74:e minuten innan Otto Rosengren ökade ledningen framspelad av Sebastian Nanasi.
Med sju minuter kvar att spela reducerade Hammarby genom Viktor Dukanovic på pass av Marcus Rafferty. Men mer än så orkade Hammarby inte med.
Söndag 24 september 17.30 spelar Hammarby borta mot Varberg. Malmö FF möter Degerfors borta på Stora Valla lördag 23 september 15.00.