Florian Niederlechner slog till efter 45 minuter och blev matchhjälte med sitt 2-1-mål.
Matchen fick ingen riktig karaktär förrän Hertha Berlin tog ledningen efter en knapp halvtimmes spel, genom Marc Kempf.
Klicka här för att följa oss på GoogleVfB Stuttgart kvitterade till 1-1 i 38:e minuten, genom Serhou Guirassy.
Hertha Berlin tog ledningen på tilläggstid i första halvleken, genom Florian Niederlechner. Andra halvlek blev mållös och matchen slutade med seger för Hertha Berlin med 2-1.
Hertha Berlin har en seger och fyra förluster och 6–13 i målskillnad på de senaste fem matcherna, medan VfB Stuttgart har två vinster, två oavgjorda och en förlust och 10–9 i målskillnad. Det här var Hertha Berlins andra uddamålsseger den här säsongen. Förlusten var också VfB Stuttgarts nionde uddamålsförlust.
Med tre omgångar kvar är Hertha Berlin sist i serien, och VfB Stuttgart är på 16:e plats.
Hertha Berlin tar sig an FC Köln i nästa match borta fredag 12 maj 20.30. VfB Stuttgart möter Bayer Leverkusen hemma söndag 14 maj 15.30.