Första halvlek blev mållös, och det dröjde till den 71:a minuten innan Christian Gunter gav Freiburg ledningen framspelad av Roland Sallai.
I den 75:e minuten ökade Nils Petersen ledningen. Det fastställde slutresultatet till 2-0.
Missa inget viktigt, följ oss på GooglePå tilläggstid fick Freiburg Nicolas Höfler utvisad, och fick spela med en man mindre sista minuterna.
Båda lagen har nu tre segrar och två förluster på de senaste fem matcherna, Freiburg med 9–5 och Wolfsburg med 10–10 i målskillnad.
Med en omgång kvar är Freiburg på femte plats i tabellen, medan Wolfsburg är på sjunde plats.
Freiburg möter Eintracht Frankfurt i nästa match borta lördag 27 maj 15.30. Wolfsburg möter samma dag Hertha Berlin hemma.