Segern var Bayer Leverkusens sjätte på de senaste sju matcherna, och fjärde raka segern på hemmaplan.
Matchen förblev jämn målmässigt till Bayer Leverkusen tog ledningen i 22:a minuten, genom Jonas Hofmann.
Laget ökade också ledningen till 2-0 i 32:a minuten, när Jeremie Frimpong fick träff. Till slut kom också 3-0 genom Victor Boniface som ökade Bayer Leverkusens ledning på pass av Jonas Hofmann i 67:e minuten. 3-0-målet blev matchens sista.
Bayer Leverkusen tar sig an Wolfsburg i nästa match borta lördag 21 oktober 15.30. FC Köln möter Mönchengladbach hemma söndag 22 oktober 15.30.