Segern var Bayern Münchens fjärde på de senaste fem matcherna.
Efter en mållös första halvlek tog Bayern München ledningen i andra halvleken och bortalaget lyckades inte resa sig.
Harry Kane gjorde tre mål, övriga mål för hemmalaget gjordes av Jamal Musiala 2, Leroy Sane 2 och Thomas Muller.
I nästa match möter Bayern München Borussia Dortmund borta på lördag 4 november 18.30. Darmstadt möter Bochum fredag 3 november 20.30 hemma.