Första halvlek blev mållös och det dröjde till den 64:e minuten innan Patrick Osterhage gav Bochum ledningen.
Kvitteringen kom på stopptid, när Niklas Stark slog till och gjorde mål för Werder Bremen. 1-1-målet blev matchens sista.
Det här var Bochums åttonde oavgjorda match den här säsongen.
Resultatet betyder att båda lagen har oförändrad position i tabellen, Bochum på 14:e plats och Werder Bremen på 13:e plats.
I nästa match möter Bochum VfB Stuttgart hemma på lördag 20 januari 15.30. Werder Bremen möter Bayern München söndag 21 januari 15.30 borta.
