Mahmoud Dahoud och Serhou Guirassy gjorde målen för VfB Stuttgart, medan Aaron Seydel nätade för Darmstadt.
Det här var Darmstadts sjunde uddamålsförlust den här säsongen. Det var även VfB Stuttgarts tredje uddamålsseger.
Darmstadt stannar därmed på 18:e och sista plats, och VfB Stuttgart på tredje plats, i tabellen.
Darmstadt möter Werder Bremen i nästa match borta lördag 24 februari 15.30. VfB Stuttgart möter samma dag FC Köln hemma.
