Första halvlek blev mållös och det dröjde till den 62:a minuten innan Nicolas Jackson gav Villarreal ledningen.
I 72:a minuten kvitterade Samuel Lino för Valencia. 1-1-målet blev matchens sista.
Klicka här för att följa oss på GoogleValencia har två segrar, en oavgjord och två förluster och 6–6 i målskillnad på de senaste fem matcherna, medan Villarreal har två vinster, en oavgjord och två förluster och 10–8 i målskillnad. Det här var Valencias sjunde oavgjorda match den här säsongen.
Resultatet innebär att Valencia ligger kvar på 17:e plats och Villarreal på femte plats i tabellen.
I nästa match möter Valencia Celta Vigo borta på söndag 14 maj 14.00. Villarreal möter Atlethic Bilbao lördag 13 maj 18.30 hemma.