Beslutet, som fattades på fredagskvällen, innebär att Trump får juridiskt understöd i sina försök att ta tillbaka omkring fyra miljarder dollar som kongressen vikt för biståndet.
De tre liberala domarna i HD motsatte sig domslutet.
Högsta domstolens beslut betyder inte att sista ordet är sagt i den finaniseringsstrid, som totalt omfattar omkring 30 miljarder dollar som kongressen godkänt för program som spänner över flera år. Två pågående stämningsprocesser, som initierats av ideella organisationer och internationella biståndsorgan, ska bringa klarhet i huruvida den exekutiva makten har rätt att blockera utbetalningar som beslutats av kongressen.
