Fem av internerna ska ha "stympats" under sammandrabbningarna, enligt inrikesminister Patricio Carrillo.
Upproret är enligt honom under kontroll efter att 800 poliser och 200 personer från specialstyrkor satts in.
— Sammandrabbningarna har avslutats men det finns väpnade fångar där inne, säger han.
Under 2021 dödades enligt ansvariga myndigheter sammanlagt 320 fångar i ecuadorianska fängelser under fängelsebråk, som i de flesta fall var gängrelaterade.
I Ecuador finns 65 fängelser med kapacitet för 30 000 interner, men de är överfulla med 30 procent. El Turi-fängelset uppges dock inte vara överfullt.
