Explosionen inträffade vid det statliga oljebolagets depå i stadsdelen Kaloum vid midnatt, natten till måndagen.
Mamady Doumbouya, som leder militärjuntan i Guinea efter en statskupp 2021, manade till lugn och vädjade till invånarna i huvudstaden att invänta resultatet av orsaken till branden.
Bränderna var inte helt under kontroll vid middagstid. Samtliga skolor hölls stängda under dagen.