Enligt uppgifterna ska den kinesiska kustbevakningen ha beslagtagit vapen från fartyget.
I måndags anklagade Filippinernas regering kinesiska fartyg för att ha rammat och skadat filippinska fartyg nära den omstridda atollen Second Thomas Shoal.
Enligt Kinas kustbevakning var orsaken till konfrontationen att ett filippinskt fartyg i området ignorerat kinesiska varningar och att man därför "vidtagit kontrollåtgärder".
