"Minst 30 personer har dödats mellan den 19 oktober och 6 november, över hela landet", säger HRW i ett uttalande. Organisationen påpekar att dödstalet inte inbegriper ett valmöte den 7 november då polis och soldater med våldsamma metoder angrep en demonstration i huvudstaden Maputo.
I valet segrade det statsbärande partiet Frelimo, som suttit vid makten i Moçambique i närmare 50 år.
Oppositionen hävdar valfusk, och oppositionsledaren Venancio Mondlane hävdar seger.
FN:s människorättskommissarie Volker Türk har tidigare varnat för att "otillbörligt och oproportionerligt våld" när Moçambiques polis angripit regimkritiska demonstranter.