Nära 40 människor räddades ur vågorna. Sök- och räddningsinsatsen fortgår, trots starka vindar.
Haveriet skedde norr om ön Samos, efter en rutt som ofta används av människosmugglare.
Migrantinflödet till Grekland har ökat med nära 25 procent det senaste året, enligt uppgifter från landets migrationsdepartement. De senaste veckorna har flera människor dött i liknande olyckor.
