Projektilen träffade skåpbilen i fråga tidigt på torsdagsmorgonen när den stod parkerad i Nuseirat i centrala Gaza.
Den israeliska militären uppger i ett eget uttalande att man "utfört ett precisionsangrepp mot fordon innehållande en terrorcell från Islamiska jihad".
Tidigare i december pekade en rapport från Reportrar utan gränser (RSF) ut Gaza som den farligaste regionen i världen för journalister.