FBI-chefen Kash Patel skriver på X att hon misstänks för att "medvetet ha lett federala agenter bort från personen som skulle gripas vid hennes domstol".
Domaren framträdde kort i federal domstol i Milwaukee på fredagen innan hon släpptes ur häktet. Hennes nästa domstolsförhandling är den 15 maj.
Trumpadmininstrationen har trappat upp kampen mot domstolsväsendet när det gäller immigrationsärenden. Justitiedepartementet beordrade i januari federala åklagare att granska tjänstemän på delstats- eller lokal nivå som motarbetar regeringens utvisningspolitik.
Migranten kunde gripas av FBI kort efter att han flytt.
