Khalil har varit frihetsberövad sedan den 8 mars utan att vara anklagad för brott. President Donald Trumps regering vill utvisa honom för hans deltagande i propalestinska demonstrationer vid universitetet Columbia i New York.
Domaren Michael Farbiarz på en federal domstol i delstaten New Jersey har redan tidigare slagit fast att Khalil bör släppas, men han gav USA:s regering en tidsfrist om att överklaga beslutet till fredagen. Domaren satte en borgen på en dollar, motsvarande knappt tio kronor, vilket Khalil har erlagt.
Domstolen anser att frihetsberövandet bryter mot landets konstitution. Efter att ha anklagats för att kunna ha skadlig inverkan på USA:s utrikespolitik – vilket avvisades av domaren – valde USA att anklaga Khalil för att inte ha svarat korrekt i sin ansökan om uppehållstillstånd i USA.
Khalil anklagas inte för direkta brott i samband med protesterna på universitetet Columbia i New York.