Bland dödsoffren fanns 33 personer som dödades när de försökte få nödhjälp vid en distributionscentral.
Mahmud Bassal, talesperson för civilförsvaret i det Hamaskontrollerade området, säger att folkmassan besköts med kulor och granateld. Israels militär uppges undersöka uppgifterna.
Distributionscentralen i fråga tillhör den kritiserade israeliskamerikanska organisationen Gaza Humanitarian Foundation, som påbörjade sina insatser för att dela ut nödhjälp i Gaza i slutet av maj. Det skedde efter Israels blockad under våren och sedan FN och andra etablerade organisationer stängts ute.
GHF har kritiserats hårt, dess strikta urval och digitala övervakning av vilka som får hjälp beskrivs av experter som ett försök att använda mat som ett militärt vapen. Och många palestinier har mist livet när de beskjutits i massan av hungrande människor som väntar på matpaket.
Enligt Israel beskjuter man endast personer som beter sig misstänkt och utgör en fara.
På onsdagen meddelade den israeliska militären att sju israeliska soldater dödats i ett sprängdåd i staden Khan Yunis i södra Gaza under tisdagen. Någon hade fäst en bomb på fordonet som soldaterna färdades i.
Gaza styrs av terrorstämplade Hamas, vars attack mot Israel i oktober 2023 utlöste det pågående Gazakriget.
