I huvudstaden Prag drabbades tunnelbana och spårvagnar som stod helt still i runt en halvtimme, enligt tidningen Blesk. Strax efter lunchtid började tunnelbanan dock rulla igen.
Brandkåren uppges ha fått rycka ut för att undsätta ett stort antal människor som fastnat i hissar.
Även nationella tåglinjer, bland annat mellan Prag och staden Kolín, har drabbats.
Strömavbrottet ska ha orsakats av mycket hög spänning, skriver tidningen Mladá fronta Dnes. Den exakta orsaken är dock ännu oklar, men enligt myndigheterna finns det inget som pekar på en cyberattack.
