Spaniens vädertjänst Aemet meddelar att runt hundra millimeter föll inom loppet av några timmar nära Barcelona.
De två personerna ska ha svepts med när floden Foix svämmade över i kuststaden Cubelles, mellan Barcelona och Tarragona. Räddningstjänsten säger på plattformen X att en sökinsats pågår.
Ovädret har ställt till kaos på olika sätt under lördagen.
All tågtrafik i Katalonien stoppades som en försiktighetsåtgärd, men återupptogs senare på dagen. Ett sjukhus i Barcelona svämmades över och fick neka patienter. Vägar har blockerats av vattenmassor och ett flygplan på väg mot USA fick vända efter det att nosen skadats av hagel.
Kraftiga regn har även drabbat bland annat regionen Aragonien.
I oktober i fjol dödades 225 människor i översvämningar i provinsen Valencia, den dödligaste naturkatastrofen som Spanien upplevt på årtionden.