Expresidenten anklagas bland annat för maktmissbruk och för att ha fabricerat ett officiellt dokument i ett försök att uppfylla ett formellt krav för att utlysa krigslagar, meddelar utredarna. Dokumentet ska sedan ha förstörts.
Han avsattes för cirka tre månader sedan efter ett riksrättsförfarande. Förra veckan greps han igen på begäran av utredarna. De nya anklagelserna innebär att han kommer att sitta frihetsberövad i upp till ett halvår i väntan på rättegång.
Yoon har hävdat att hans dekret om krigslagar var ett desperat försök att få allmänhetens stöd för hans kamp mot det liberala oppositionspartiet Demokratiska partiet (DP).