Migranterna upges ha anlänt från Libyen.
”De har inte rätt att ansöka om asyl, de kommer inte att föras till mottagningscenter, utan kommer att hållas i polisförvar till processen för deras återvändande inleds”, skriver Plevris.
Av de 200 migranterna ska 190 ha anlänt till Kreta, ytterligare 11 ska ha påträffats vid ön Agathonisi som ligger nära den turkiska kusten. Enligt statliga medier ska en av migranterna ha skadats och sedan dött på sjukhus.
Över 2 000 migranter har anlänt med båt till Grekland under juli månad, något som har väckt ilska bland lokala tjänstemän och turistföretagare som satt press på den konservativa regeringen att vidta återgärder för att stoppa flödena.
Asylstoppet trädde i kraft den 11 juli och gäller under tre månader. Migrationsdepartementet har även förberett en lagstiftning som möjliggör förvar av migranter i upp till två år för olaglig inresa och upp till fem år om de ertappas med att vistas olagligt i landet.