Cirka 1 900 hushåll med 6 000 personer fick snabbt evakueras i samband med upptäckten.
Bomben upptäcktes av byggnadsarbetare i ett bostads- och affärsdistrikt i västra delen av staden på fredagskvällen.
"Vi har bekräftat att föremålet är en bomb från andra världskriget", säger en polistjänsteman till nyhetsbyrån AP.
Arbetet med att desarmera bomben pågick under lunchtid på lördagen, lokal tid. Ingen person ska ha skadats.
Hongkong ockuperades under det andra världskriget av japanska styrkor och bombades av USA för att störa de japanska försörjningslinjerna.
