Enligt domstolen har den nederländska staten diskriminerat öborna genom att inte agera tillräckligt snabbt eller på rätt sätt. Regeringen måste nu ta fram en plan för hur ön ska skyddas.
Domen kan bli vägledande för liknande fall.
Klicka här för att följa oss på GoogleBonaire, som ligger i Västindien, har sedan 2010 status som särskild kommun inom Nederländerna.
En grupp invånare har, tillsammans med nederländska Greenpeace, drivit fallet eftersom de menar att regeringen inte gör tillräckligt för att skydda ön mot klimatförändringar.
Delar av ön riskerar att sväljas av havet före nästa århundrade. Dessutom hotas korallrev runt ön, rev som lockar de turister som står för en betydande del av öns intäkter.
