Bosättare med bulldozer hade upprättat nya ställningar på mark utanför Betlehem som ska stå under palestinsk kontroll, enligt palestinska och israeliska uppgifter.
Israels militär rapporteras ha fört bort bosättarna från området på torsdagen, men de ska sedan ha återvänt.
I händelseförloppet som följde sköt bosättarna ihjäl en man i den palestinska familj som äger marken, vittnar anhöriga för Haaretz. Enligt Palestinska röda halvmånen sköts mannen i huvudet. Tre andra skadades. Enligt israelisk polis har en misstänkt skytt gripits.
I en separat bosättarräd på norra Västbanken på torsdagen vittnar palestinier om skottlossning och fler skadade.
