Dådet inträffade i förorten med samma namn, omkring en mil utanför huvudstaden Damaskus. I ett uttalande från shiamuslimernas högsta råd i landet sades det att det rört sig om ett riktat attentat.
Enligt rådet dödades imamen Farhan Hassan al-Mansour när ”hans bil utsattes för ett explosivt föremål”.
Ingen grupp har tagit på sig ansvaret för dådet.
Det finns omkring 300 000 shiamuslimer i det av inbördeskrig sargade Syrien, där en stor del av befolkningen är sunnimuslimer.
Religiösa minoriteter oroas över utvecklingen i landet sedan islamister, ledda av nuvarande interimspresidenten Ahmed al-Sharaa, störtade Bashar al-Assads regim och tog makten.
