Det är första gången som Ymer lyckas ta sig till kvartsfinal i den svenska huvudstaden.
Ett nyckelmoment i matchen kom vid ställningen 3–3 i första set. Då bröt Ymer sin motståndarens servegame och tog till sist hem setet med 6–3.
Det andra inledde svensken i rasande takt och tog tre första gamen. Men Prizmic gav sig inte så lätt. 18-åringen hämtade upp, utjämnade och vann andra set med 6–3.
Ett tredje och avgörande set följde där kombattanterna bytte servegame med varandra innan Ymer gick i från och till sist vann klart med 6–2.
Elias Ymer är ensam svensk kvar i turneringen sedan både Leo Borg och Karl Friberg slagits ut.
I kvartsfinalen väntar serben Miomir Kecmanovic som överraskande slog ut titelförsvararen, danske världssexan Holger Rune.
Den matchen spelas på fredag klockan 15.00.