59-åringens avtal gäller till och med den 30 juni 2025.
John van 't Schip har tidigare varit både spelare, ungdomstränare och assisterande tränare i Ajax. 2009 var han också tillfällig huvudtränare i klubben.
Tidigare huvudtränaren Maurice Steijn fick sparken under säsongen och ersattes tillfälligt av Hedwiges Maduro.
