Pochettino kom till Stamford Bridge inför den här säsongen sedan amerikanske ägaren Todd Boehly och hans kompanjoner gjort sig av med både Thomas Tuchel och Graham Potter under förra spelåret.
Under Boehly har Chelsea spenderat enorma summor på spelare utan att nå framgång.
Pochettino lyckades först mot slutet av säsongen få ihop ett slagkraftigt lag. Chelsea avslutade Premier League med fem raka segrar och nådde en slutlig sjätteplats som ger spel i Europa Conference League i höst.
Klubben nådde även finalen i ligacupen där det blev förlust mot Liverpool efter förlängning.
Pochettino har ännu inte tagit en titel i England. Chelsea var hans tredje klubb i Premier League efter Southampton och Tottenham.
I och med att han lämnar Chelsea gör sig klubben även av med hans team bestående av Jesus Perez, Miguel d’Agostino, Toni Jimenez och Sebastiano Pochettino.