"Klubben har en tydlig vision för att nå framgång, både på och utanför planen, och jag är tacksam för det förtroende som ges till mig att leda det här talangfulla laget", säger han till klubbens webbplats.
Eidevall, som har skrivit på för tre år, var Arsenals tränare under drygt tre säsonger och har tidigare bland annat haft huvudansvaret i damallsvenska Rosengård.
I San Diego finns svenska landslagsspelaren Hanna Lundkvist.