Den 24-åriga svenskan förlorade kvartsfinalen mot Lucia Yepez Guzman, som tog OS-silver i fjol. När ecuadorianskan tog sig till final gav det Malmgren en ny chans i återkvalet – och där besegrades Laura Helin Avila, Kuba, med 9–1.
Malmgrens bronsmatch inleder torsdagskvällens finalpass, klockan 18, skriver Svenska brottningsförbundet.
Jonna Malmgren har tidigare två EM-guld och ett guld i U23-VM.