Inför matchen stod MFF på endast en inspelad poäng och jagade därmed höstens första seger i ligafasen av Europa League.
Laget leddes för sista gången av den tillfällige tränaren Anes Mravac, som i januari lämnar över ansvaret till Miguel Ángel Ramírez.
Klicka här för att följa oss på GoogleMravac bjöd på en oväntad överraskning i startelvan när 17-årige Theodor Lundbergh fick chansen från start för första gången.
Malmö höll jämna steg med Porto i början, men det var hemmalaget som skapade de farligaste chanserna.
Till slut fick också Porto utdelning – två gånger om. Samuel Aghehowa gjorde 1–0 efter en halvtimmes spel och sex minuter senare ökade han på till 2–0. MFF fick till en reducering på stopptid genom ett självmål.
Förlusten innebär att Malmö FF hamnar 34:a av 36 lag i Europa Leagues ligafas.
