Zeneli fick inleda på bänken när serieledande Union Saint-Gilloise, med 39 poäng, tog emot jagande Club Brygge som stod på 38.
I den 64:e minuten byttes Zeneli in och med en kvart kvar ordnade svensken segern.
Sedan flytten från Elfsborg har 23-åringen hunnit spela tio matcher i den belgiska klubben, där han noterats för tre mål och fyra assist. Nyligen utsågs han även till månadens spelare i ligan.
Han fanns också med i Graham Potters playoff-trupp, där var han starkt bidragande till Viktor Gyökeres avgörande mål i finalen mot Polen när Sverige gick till VM.
Sju omgångar återstår av den belgiska mästerskapsserien.
