Det stod 0-0 efter den första halvleken och det var först i den andra halvleken som första målen kom.
Rene Makondele kickade bollen till Moestapha El Kabir, men domaren valde felaktigt att döma bort målet för offside.
Men trots det och en vecka full av kaos lyckades AIK ta sig samman.
AIK tog ledningen när det var 20 minuter kvar av matchen. Alexander Milosevic nickade bollen till Henok Goitom som satte 1-0.
Under tilläggstiden ökade Robert Åhman Persson på ledningen och segern gick till AIK som slog Häcken med 2-0.
