Tokyobörsens Nikkei 225-index var ned 1,5 procent när handlarna gick på lunch, medan det bredare Topixindexet pekade på minus 1 procent.
I Hongkong var samtidigt Hang Seng ned 2,4 procent. Shanghaibörsen höll stängt på grund av helgdag.
Spänningarna mellan världens två största ekonomier ökade i helgen, sedan USA anklagat Kina för att ha brutit en uppgörelse från i maj om att sänka tullar.
Kina ”avvisar bestämt” påståendena och meddelar att Washington ”har framfört falska anklagelser” som "allvarligt strider mot fakta”.
Förra veckan hävdade USA:s president Donald Trump att Kina "fullkomligt brutit mot överenskommelsen med oss", utan att precisera på vilket sätt avtalet hade brutits.
