Bolaget anklagas för att ha vilselett kunder till att registrera sig som medlem i tjänsten Prime och sedan gjort det svårt att säga upp abonnemanget.
Beloppet är fördelat på 1 miljard dollar i böter och 1,5 miljarder dollar i ersättning till kunder, sammanlagt motsvarar det nära 24 miljarder kronor.
Amazon medger inte i uppgörelsen att bolaget gjort något fel.
Prime är dels en strömningstjänst för film och serier, dels ett sätt att få snabbare frakt och rabatter från näthandeln.
FTC påbörjade en utredning av Amazons prenumerationstjänst 2021 och stämde företaget 2023.