Nikkei 225 stängde 1,1 procent lägre.
Bland förlorarna märktes Nintendo som tappade 2,7 procent inför sin kvartalsrapport senare under dagen, medan Sony tappade sex procent.
I Kina och Taiwan fortsätter börserna att hålla stängt till följd av firandet av det kinesiska nyåret.
Seoulbörsens Kospi-index hade strax före stängning stigit 1,7 procent procent.
