Pojken hittades i ett skogsparti Upplands Bro i fredags och har nu identifierats.
Sedan tidigare sitter en 15-årig pojke häktad i ärendet och under förmiddagen ändrades brottsrubriceringen för honom från medhjälp till människorov till medhjälp till mord.
– Det har framkommit omständigheter i ärendet som gör att misstanken nu är medhjälp till mord. Vilka omständigheter det är kan jag inte gå in på, säger åklagare Hanna Cardell, som leder förundersökningen, i en kommentar.
14-åringen försvann från HVB-hem
14-åringen vistades på ett HVB-hem och efterlystes i slutet av juli.
Polisen utreder också kopplingar till att en annan 14-åring som hittades död utanför Nynäshamn i slutet av juli. De två 14-åringarna hade bott på olika HVB-hem i Nyköpings kommun.
